MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pG-09EL50

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018652	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480050
2	NC_018652	TCGC	2	8	37	44	0 %	25 %	25 %	50 %	410480050
3	NC_018652	GCG	2	6	64	69	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480050
4	NC_018652	TGT	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480050
5	NC_018652	GTT	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480050
6	NC_018652	AGG	2	6	235	240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480050
7	NC_018652	GC	3	6	245	250	0 %	0 %	50 %	50 %	410480050
8	NC_018652	GGT	2	6	345	350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480050
9	NC_018652	GGC	2	6	436	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480050
10	NC_018652	T	8	8	446	453	0 %	100 %	0 %	0 %	410480050
11	NC_018652	GGC	2	6	490	495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480050
12	NC_018652	TTG	2	6	617	622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480051
13	NC_018652	CTAA	2	8	731	738	50 %	25 %	0 %	25 %	410480051
14	NC_018652	T	6	6	743	748	0 %	100 %	0 %	0 %	410480051
15	NC_018652	AAT	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480051
16	NC_018652	CAG	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480051
17	NC_018652	CTT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480051
18	NC_018652	GTT	2	6	1014	1019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480051
19	NC_018652	T	6	6	1050	1055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018652	CAT	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018652	TTG	2	6	1124	1129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018652	TAAA	2	8	1183	1190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018652	A	6	6	1188	1193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018652	A	7	7	1200	1206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018652	GCAAC	2	10	1259	1268	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_018652	T	7	7	1408	1414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018652	CCGT	2	8	1416	1423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.